KTU plėtojami fizinių, technologijos ir socialinių mokslų tyrimai ir eksperimentinė plėtra, skatinami biomedicinos ir humanitarinių mokslų tyrimai. Moksliniai tyrimai vykdomi 8-iuose tyrimų institutuose:
Įkurtas 1958 m. Integruotas į Kauno technologijos universitetą 2010 m.
Įkurtas 1994 m. Kauno technologijos universitete
Įkurtas 2014 m. Kauno technologijos universitete
Įkurtas 2015 m. Kauno technologijos universitete
Įkurtas 1960 m. Kauno politechnikos institute
Įkurtas 1956 m. Kauno politechnikos institute
Įkurtas 1991 m. Kauno technologijos universitete
Įkurtas 1999 m. Kauno technologijos universitete